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東京地検特捜部検事の正崎善は、製薬会社の不正事件を追ううちに、1枚の奇妙な書面を発見する。そこに残されていたのは、毛や皮膚の混じった異様な血痕と、紙一面を埋め尽くすアルファベットのFの文字だった。

突然の仲間の死に納得のいかない正崎は、域長選挙を控えた政治家の報復とみて捜査を進める。九字院と半田の協力もあり、正崎は新たに捜査線上に浮上した女性を参考人として事情聴取することに成功する。

自明党幹事長の野丸の口から語られる新域構想の真の目的。検察庁とのつながりも露わになり戸惑う正崎だが、引き続き因幡と仲間の死の真相を追う。捜査を進めるうちに、正崎は接待に利用されていた女性に目をつける。

齋の宣言から一日がたち、世間は混乱をきたしていた。齋の捜索が急がれる一方、現段階では齋の行動に違法性を問えない事実にも直面していた。そんななか、正崎のもとに新任事務官として瀬黒が配属される。

謎の女・曲世の素性を調べるため、正崎と瀬黒は京都の叔父のもとへ。そこで語られたのは、曲世が中学生の頃に学校で起きた不可思議な事件。そして、彼女のカウンセリングをした彼自身の信じがたい実体験だった。

域議選挙まで残り3日を切り、齋が出演する公開討論が目前に迫っていた。正崎たちは必死に捜査にあたるが、齋を逮捕できる証拠をいまだ掴むことができない。そんななか、九字院の言葉から正崎はある作戦を考える。

公開討論に登場した少年の正体に世間は驚がくする。隠し玉を逆手に取られた野丸になす術はなく、正崎たちは予定どおり齋の拉致作戦を開始する。問題なく任務が遂行されていくなか、ある異変が静かに起き始めていた。

議会選挙を終え、新域では自殺法の本格的な運用が始まろうとしていた。齋拉致計画の一件から謹慎処分を受ける正崎になす術はなく、無力感に苛まれる日々を送る。そんなある日、正崎のもとに、ある人物が訪れる。

ハートフォード市がアメリカ初の自殺法導入宣言を行った。ホワイトハウスでは緊急会議が開かれ、アレックスは市長のフローレスと電話会談を行う。新域での発令以降、自殺法導入の試みが世界各地で伝播していた。

ホスピスでフローレスの電話記録を耳にした正崎とハーディ。そこへ、ドイツとイタリアで同時に自殺法導入が決定したとの速報が入る。混乱を極めるなか、2人の目の前でさらに予想外の事態が発生する。

G7サミットが開幕。自殺法都市を国内に抱える7人の首脳が一堂に会し、自殺法に対するスタンスを表明する。道徳、経済、権利とさまざまな観点で意見が交わされるなか、アレックスは議論の本質に迫る問いを提示する。

自殺サミットを開催した齋からアレックスへの要請。それは、自殺をすべきか思い悩む1人の少女との対話だった。深い思慮の果てに、善悪の真理に近づきつつあるアレックスは、少女との対話に応じる。