ファイ・ブレイン～神のパズル　第3シリーズ【アニメ】の動画配信サービス比較と無料で全話視聴する方法

失われた真方ジンの記憶を取り戻そうと、カイトらはイギリスでパズルをめぐる旅をしていた。昔、幼いカイトとルークがジンと出会った教会の地下迷路を歩いていると、カイトの前にある少女が現れる。

カイトはレイツェルが仕掛けたパズルに苦戦。正解を見つけられなけば、ノノハやルークと共に崩壊するパズルに巻き込まれる。その頃、√学園ではギャモンらが「マスターブレイン」の男・フーダニットに襲われていた。

タマキ、アイリ、エレナは√学園に転校してきたレイツェルを歓迎する。ギャモンはレイツェルにその目的を問い詰めた。すると、レイツェルは「カイトがジンの記憶を取り戻せるか知りたい」とはぐらかす。

カイトとノノハが、ジンを連れ出してピクニックをしているとレイツェルが現れた。ジンがパズルの楽しさを教えてくれたというカイトと、ジンがパズルを憎んでいたと主張するレイツェル。両者の争いは平行線となる。

真方ジンがレイツェルと共に旅をしていた「空白の1年」の足取りを調べていたルークが、カイトとレイツェルを呼び出す。そこでルークは、かつてジンから「パズルは鎖、パズルは鏡」という言葉を聞いたと話す。

エレナたちから歓迎会に誘われたレイツェルは一緒にショッピングモールやプールで時間を過ごす。レイツェルは何かたくらみがあるのでは、と警戒していたが、ジンのブローチがきっかけとなって、本当の笑顔を見せる。

ジンは自分が愚者のパズルを作っていたと知り、ショックを受ける。するとカイトが昔ジンから教わったパズルを見せて励ます。ジンは、自分がマスターブレインと無関係だと証明するために、記憶を取り戻そうとする。

カイトらはメランコリィと和解したいというフリーセルの希望を知り、ディナーの招待を受ける。微妙な緊張感をはらみつつ、食事そして食後の会話が続く。覚悟を決めたフリーセルはメランコリィに話しかけようとする。

エニグマに関するPOGの情報収集が難航するなか、突如として、そのエニグマ本人からバロン、ソウジ、ルークたちが招かれる。エニグマは「隠し事はしない」と宣言してから「空白の1年」について語りだす。

レイツェルが仕掛けたパズルに挑戦して消えたジンの行方を追うカイトたち。ヒントの写真を手掛かりにアメリカのとある空港にたどり着くが、小さな誤解から、偶然出会った兄妹とギャモンの間でトラブルが起きる。

カイトたちと合流するため、キュービックとアナはイグアスの滝にやってきた。しかし、悪天候が原因でカイトたちはテキサスの空港で足止めされていた。アナはすっかり観光気分で、イワシミズ君はわがままになる。

ペルーにやってきたカイトたちは、古い遺跡の中でパズルを発見。そこで待ち受けていたのは、あのヘルベルト・ミューラーだった。ヘルベルトは、自らの再起を懸けて、天びんパズルを仕掛けてくる。

不甲斐ないマスターブレインたちに危機感を募らせ、自らカイトと対決することにしたレイツェルは、マヤのピラミッドでジンを財とした迷路を仕掛けてきた。カイトたちはレイツェルの宣言を聞いて、慎重に迷路を進む。

カイトたちを救おうと、エジプトのピラミッドでレイツェルが仕掛けた迷路に挑むルークとフリーセル。迷路をふさぐ壁の攻略法をすぐに見抜き、最短ルートでゴールを目指す。しかし、途中で行き詰まってしまう。

バロンに呼び出されたカイトたちは孤島を訪れる。そこには、かつてPOGの訓練施設があった。崖の上に立つ墓には、POGでジンのライバルだったソルヴァー、ラヴーシュカが眠っているというのだが…。

自分がエニグマに利用されていたことや、カイトの信じるジンがおそらく本当の姿だと認めるレイツェル。旅に出た理由は、ジンに記憶を取り戻させないためだった。もし、記憶が戻れば、ジンはカイトを選ぶからだ。

「オルペウス」だと名乗る男が現れたのと同時に、カイト、ルーク、フリーセルは世界が滅ぶ未来を見る。さらに、カイトはパズル中に鉄球に弾き飛ばされてレイツェルが死んでしまった「異なる過去」を実体験する。

幼いカイトが父と母を救っていたら。フリーセルの母がオルペウス・リングを着けることがなかったら。ノノハがパズルを解いていたら。オルペウスはアムギーネに到着したカイトたちに、過去のビジョンを見せる。

カイトたちが試練のパズルに挑む。同じ頃、ギャモンとエレナはアムギーネで歓待を受ける。だが、オルペウスに対し、「早くパズルをさせろ」と言い放ったギャモンは、エレナと共に賢者のパズルに放り込まれてしまう。

ジンの解放と引き換えに、オルペウスの器となることにしたレイツェル。腕輪を手に入れようと、オルペウスが作った超空間に浮かぶ賢者のパズルに挑む。彼女はその空間でジンと旅をしていた頃の幸せな自分を見る。