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転校初日からピンチに陥っていた倉科明日香は、偶然通り掛かった日向晶也と鳶沢みさきに助けられたことから、反重力で空を飛べる靴、通称グラシュを使った新興スカイスポーツ・フライングサーカス（FC）に出会う。

初めてFCを体験した明日香は久奈浜学院FC部への入部を決意。みさきと後輩の有坂真白も入部することになり、その様子を複雑な思いで見つめていた晶也は、急遽明日香とみさきの練習試合でセコンドを務めることに。

FC部顧問・各務葵の提案で始まった、名門・高藤学園との合同合宿。ハードな練習で久奈浜FC部の面々も着実に上達していく。迎えた合宿最終日、久奈浜VS高藤の練習試合が行われることになり…。

実力テストの追試を受ける羽目になった真白は、明日香とみさきが急速にFCを上達していることに気付き危機感を覚える。練習でもうまくいかず、自主練を始めた真白は、帰宅中の莉佳に野良試合を申し込む。

ついに始まった全日本フライングサーカス選手権夏季大会仇州西部地区予選。初めての大会に明日香のテンションも上がり、真藤の姿を見たみさきも再戦をと気合いが入る。そしてトーナメントの組み合わせが発表され…。

1回戦を勝ち抜いた明日香とみさきは、大会2日目の2回戦へ。黒渕と対戦した明日香は、延長戦の末に勝利し笑顔を見せた。そして、みさきの相手は、優勝候補の筆頭に挙げられる高藤学園のエース・真藤一成だった。

準決勝、明日香は真藤を相手に奮闘したが力及ばず敗退。盛り上がる会場で決勝戦の組み合わせが発表される。Bブロックは去年の覇者・真藤。そしてAブロックは誰もが予想していなかった初出場の選手・乾沙希だった。

2学期が始まると同時に退部届を出したみさき。驚いた明日香たちは、真相を問いただそうと四苦八苦するが、みさきははぐらかし続ける。そんなみさきの姿に昔の自分を重ねた晶也は、自らの過去を話しだす。

沙希との練習試合に負け、風邪を引いて休んでしまった明日香。元気を出そうと口ずさむのは、幼い頃に勇気をもらった思い出の曲だ。大丈夫だと明るく振る舞うが、彼女はなぜか空をうまく飛べなくなってしまっていた。

秋の大会に向け、気持ちも新たに猛特訓を始めた久奈浜FC部一同。「もっと飛びたい、もっと戦いたい」と上を目指し、FCに打ち込む彼女たちの姿に、晶也は自分ができることは何かを模索する。

打倒乾沙希を目指した猛特訓を経て、いよいよ始まった秋季大会。お互いの全力をぶつけ合う真白と莉佳に触発され、明日香、みさきたちも気合いを入れる。一方、その試合に無関心なイリーナと沙希は…。

試合に勝利するも、全てを出し切ったみさきに心揺さぶられた沙希。美しくない勝利だと憤るイリーナに、次は自分たちのFCを完璧に披露すると宣言する。そして迎えた決勝戦、それぞれの思いを胸に決勝の幕が上がる。