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少し科学が進んだ未来。18歳の水柿ツカサの就職先は、世界的な大企業のSAI社。心を持った人型のアンドロイド、通称「ギフティア」を製造、管理する会社だ。ツカサはターミナルサービスという部署に配属された。

ツカサはパートナーのギフティア・アイラと共にターミナルサービスの仕事に取り組むが、アイラのミスで失敗の連続だった。ツカサは一つ年下の教育係・ミチルに怒られてばかりで、上司のカヅキも心配していた。

ツカサはアイラと同じ部屋で暮らし始める。ターミナルサービスではパートナー同士が一緒に住むことが決まりだった。2人の生活がスタートするが、アイラは部屋ではツカサのことを完全に無視し、終始無言だった。

ツカサは家でもアイラと話せるようになり、距離の縮まった2人の様子がミチルには面白くない。ツカサたちは、アンドロイドチルドレンと呼ばれる子供から親代わりのギフティアを回収する新たな仕事に就く。

闇回収屋の接触により、買い物に行ったまま戻らないマーシャの寿命は残り24時間。ツカサたちは全員で手分けしてマーシャを捜索する。さらに、これを知った伍堂が民間警備会社のアール・セキュリティ社を動かす。

意識を失い、眠ったままのアイラ。3年前のカヅキに続いてツカサにもパートナーを解消されるのではないかと不安に思うアイラだが、目覚めると、そこにはメンテナンス中ずっとアイラに付き添っていたツカサがいた。

アイラに残された時間を知ったツカサはデートに誘うことを決心するが、アイラがミスを連発してなかなか切り出すタイミングを掴めない。そこで、またしても男性社員たちの温かいアドバイスを受けることになるが…。

回収対象のギフティアのOS入れ替えを希望するオーナーに対し、ツカサはそれによって前の記憶が戻ることがないのかと疑問に思う。そんな中、第3ターミナルサービス所属のギフティア・アンディが派遣されてきた。

アイラに告白してあっさり振られたツカサは、燃え尽きて真っ白な状態になっていた。 一方でアイラは、告白されたことでパニックに陥っていた。ターミナルサービスの面々は、そんな2人が気になって仕方ない。

カヅキの指示により、ツカサとアイラはパートナーを解消することになった。理由を尋ねるツカサに対してカヅキは「社内恋愛禁止」と答えるが、ターミナルサービスのほかのメンバーはそんなルールは知らないと言う。

ついにツカサとアイラは恋人同士になった。手も繋げない初々しい2人を見守るターミナルサービスの仲間たち。恋人とうまくやっていくためにはサプライズが必要だと言われたツカサは、アイラを喜ばせる方法を考える。

寿命が近づいてきたアイラは、夜になると自分がまだ存在しているか不安になり涙する。昼間は気丈に振る舞うアイラとツカサに、みんなから映画のチケットやレストランの招待券などさまざまなプレゼントが贈られる。

アイラの回収日。オフィスに出社したツカサとアイラを待っていたカヅキは、いつも通り働こうとしているアイラの社員証を取り上げ、「さっさと帰れ」と2人を追い返す。最後の一日。2人は遊園地へ向かった。