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１年生キャプテン・谷口の下、墨谷高校野球部は倉橋・半田・鈴木という新メンバーを加え再始動。強豪・川北高と練習試合するが、初回から引き離される墨高ナイン。

谷口は、人差し指の怪我が治る可能性があるという言葉を医師から聞く。しかし失敗すれば二度と野球はできなくなるという。手術を受けるか悩み苦しみ、ふと神社に行った谷口は…？

谷口の下に松川・島田・加藤という精鋭が加わった。彼らに感化され、練習に力を入れる部員たち。谷口は夏の大会の目標に５回戦進出を掲げ、対戦する可能性のある高校を手分けして偵察し始める。

地区予選１回戦・言問高校との試合。９回表、１点差を縮められず最後の攻撃となり、焦り始めた墨高ナインは、倉橋の心理作戦と谷口の３塁打で逆転のチャンスをつかむ。

墨高の４回戦の相手は強豪のシード高・聖陵高校。特訓中、前キャプテンの田所が訪れ、４回戦突破すれば鰻丼を奢ると約束を交わす。そして試合開始、先発は１年の松川だが、初回から猛打を浴び…

聖陵キャッチャー西田の行動が走塁妨害だという倉橋の抗議は審判に認められない。しかし、今度は中山が守備妨害でアウトに。谷口は倉橋の行動の意味を理解し、改めて頼もしく思うのであった。

最後の攻撃。谷口の機転と聖陵のミスから、ツーアウト２点差まで追い上げる。倉橋がヒットを放ち、松川が本塁に達しようとした時、西田はまたも走塁線上にキャッチャーマスクを置く。

５回戦の相手・専修館高校の試合を偵察した墨高。谷口はその実力に焦りを感じ、墨谷二中時代にやっていた至近距離のノック特訓を開始する。試合前日とは思えぬ激しさに弱音を吐くナインたち。

特訓が功を奏して、エース百瀬の速球にタイミングを合わせ始める墨高。だが、専修館バッテリーはスローカーブと速球との緩急で墨高を困惑させ、１点を先取する。

専修館に引き離されている墨高は８回裏の攻撃。巧妙なチェンジアップの対抗策が見つからない谷口は、弱気な一面を見せ始めてしまう。そんな時、半田は専修館対策メモの図に疑問を抱く。

専修館との死闘で全力を出し切った墨高ナインは、準々決勝を前に休息をとっていた。翌日、試合開始を迎えるが、これまで少人数で連戦を続けてきた墨高は、貫禄ある明善高に圧倒されてしまう。

墨高野球部に丸井が入部してきた。ライトとなった半田の勘の鈍さに疑問を抱く倉橋。一方、丸井が独学で硬式野球を学んだと知った谷口は、セカンドを丸井、半田と鈴木にライトを競わせる。

秋季大会ブロック予選、墨高は東実との決勝戦まで登り詰める。しかし鈴木が怪我で欠場、半田が公式戦初出場することに。序盤から東実エースの球に喰らいつく墨高だが…。