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幼馴染みの粉月マヒルと一緒に見知らぬ異世界へやってきた高校生・弓削イツキ。そこは“ケガレ”によって危機に瀕していた魔法世界・グランバニアだった。イツキはこの世界を救う“マレビト”として召喚されるが…。

初めての愛好の儀を行ったイツキとマヒル。気持ちを高めて触れ合った末に、ケガレを浄化するために戦う“星の子”が誕生する。その後、2人は愛好の儀の相手となる“12星座の巫女”が集められた星神学園へ転入する。

想像以上に手強いケガレを倒すため、イツキは一度に2人の巫女を相手にする“W愛好の儀”を行う必要に迫られる。W愛好の儀によって強力な星の子を作れるというのだが、実際に行われた前例はなく…。

魚座の巫女・ユウハと親しくなったイツキ。絵描きの彼女は棺桶をベッド代わりにしていて、その中で眠っている時に見る夢を絵にしていた。最近スランプだという彼女を気分転換させようと、イツキはデートに誘い…。

イツキと巫女たちの仲を深めるための海水浴ツアーが行われる。だが、それを知った学園一のプレイボーイ・セイヤが付いてきてしまう。そんななか、イツキはリリスからこのままでは近いうちに死ぬと予言され…。

次なる愛好の儀の相手として、マナは水瓶座の巫女・コレットをイツキに薦める。しかし、イツキは純真無垢な彼女の姿を目の当たりにして、自分が手にかけてしまって良いものなのかと悩んでしまう。

コレットはおじいさん秘伝の幸せのパンを再現して客を呼び込み、潰れかけているパン屋を復活させようとしていた。イツキも彼女に力を貸し、おじいさんが残したわずかな手がかりを頼りに試作を重ねていく。

イツキのお守り役を務める妖精・マナは、まだ愛好の儀を行っていない巫女たちのハートに火をつけようと、“究極の愛好の儀”を企画する。その相手になれるのはデートバトルでイツキの心を射止めた1人だけで…。

ケガレ神が巣食う星屑の迷宮のほかに、13番目の迷宮が存在することが発覚する。さらには13人目の巫女の存在も発覚し、イツキはその巫女を探し始める。しかし、その13人目が男性である可能性が浮上する。

ようやくイツキの前に13番目の巫女を名乗る女性が現れる。しかし、その奇抜な80年代的な勝負服を身にまとった女性の告白に、イツキは彼女こそが巫女だと気づくことができずにスルーしてしまう。

グランバニアにも冬の季節が到来し、街がクリスマスらしいお祭りムードに包まれる。そんななか、イツキはシャングリラから衝撃的な事実を告げられる。それは、“13番目の幻影”を倒す唯一の手段についてだった。

イツキは愛する者と共に生きる未来を掴むため、最後の戦いに挑む。だが、“13番目の幻影”に攻撃が通用せず、絶望的な状況に追い込まれる。その時、「イツキと一緒にいきたい」という巫女たちの思いが奇跡を呼ぶ。